《中国临床药理学与治疗学》主要刊登以下内容的中英文稿件：用药方案设计的临床研究、基础研究、以及评价；药物联用，以及药物与其他治疗手段联用的临床研究或基础研究；以人体或人体构件（如血管、细胞等）为实验对象的临床药理学研究；以疾病动物模型为实验对象的基础药物治疗学研究；临床药物的试验与统计；与临床药理学和治疗学相关的实验方法学及非传统手术的治疗方法。以从事新药研发、临床药理学及药物治疗学研究的医疗、科研及教学人员为读者对象。

《中国临床药理学与治疗学》栏目设有专论、基础研究、临床药理学（包括药物基因组学及药物蛋白组学等）、定量药理学（包括药代动力学、药效动力学及药物临床评价等）、药物治疗学、综述与讲座、医院药学之窗、短篇报道、读者·作者·编者等。

栏目设置：专论、基础研究、临床药理学、定量药理学、药物治疗学、综述与讲座、医院药学之窗、短篇报道、读者·作者·编者等。